重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，国家临床医学研究中心。最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、教育部重点实验室、国家级国际科技合作示范基地、国家级继续医学教育基地、国家级教学团队、国家精品课程、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、儿科唯一的全国住院医师规范化培训示范基地、国家级儿童早期发展示范基地、儿科唯一获得肝移植资质的儿童医院。国家干细胞临床研究备案机构、重庆市儿科临床医学研究中心；拥有5个重庆市重点实验室和1个重庆市干细胞治疗工程中心,全国文明单位。在全国最佳医院排行榜中位居全国儿童医院第三位，儿内科综合排名居全国儿童医院第二位，儿外科居第三位，科研产出居第一位。近十二年中我院科研综合指数、学术期刊发文量居全国儿童医院第一位；2018年中国医院科技量值(SETM)排名中，我院综合居全国儿童医院第二位。
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